Ο έλεγχος των αλιευτικών δραστηριοτήτων δεν αφορά μόνο τον έλεγχο των δραστηριοτήτων των αλιεών στη θάλασσα, κάτι που έχει υψηλό οικονομικό κόστος και που από μόνο του δεν διασφαλίζει την εφαρμογή των κανόνων της Κοινής Αλιευτικής Πολιτικής και των προνοιών των Κανονισμών του Ελέγχου.

Οι έλεγχοι πραγματοποιούνται σε κάθε σημείο της διαδρομής των αλιευμάτων από το σκάφος μέχρι τη λιανική πώληση.

Αν και πραγματοποιουνται έλεγχοι εν πλω, η δραστηριότητες του Τομέα Ελέγχου εστιάζονται κυρίως:

• στους λιμένες όπου τα αλιεύματα εκφορτώνονται ή μεταφορτώνονται
• κατα τη μεταφορά τους
• σε εγκαταστάσεις μεταποίησης
• στα σημεία λιανικής πώλησης