Ένας από τους σημαντικότερους παράγοντες για τη σωστή διαχείριση αλλά και προστασία των υπόγειων υδάτινων πόρων, είναι η λειτουργία κατάλληλων δικτύων παρακολούθησης. Κυριότερος σκοπός των δικτύων αυτών είναι η έγκαιρη και έγκυρη διαπίστωση, τόσο των ποιοτικών όσο και των ποσοτικών μεταβολών των χαρακτηριστικών των υπόγειων υδάτων, με απώτερο στόχο την πρόληψη της υποβάθμισής τους.
Προς την κατεύθυνση αυτή το Τμήμα Γεωλογικής Επισκόπησης εγκατέστησε και λειτουργεί δύο (2) κύρια δίκτυα παρακολούθησης της ποιότητας των υδάτων, το δίκτυο για την προστασία των υδάτων από τα νιτρικά άλατα γεωργικής προέλευσης (εικόνα 1) και το δίκτυο για την προστασία των υπόγειων υδάτων από τη ρύπανση και την υποβάθμιση.........