Στο Εργαστήριο Γεωργικής Χημείας (ΕΓΧ) η ερευνητική δραστηριότητα επικεντρώνεται στα θέματα ασφάλειας γεωργικών προϊόντων όπως η υπολειματικότητα φυτοφαρμάκων με στόχο τον προσδιορισμό των μέγιστων πιθανών υπολειμμάτων που είναι δυνατό να προκύψουν μετά από λανθασμένη χρήση και όχι σύμφωνα με τις εγκεκριμένες οδηγίες χρήσης τους. Επίσης το ΕΓΧ πραγματοποιεί χημικές αναλύσεις που εμπίπτουν σε ερευνητικά προγράμματα για στήριξη άλλων Κλάδων του Ινστιτούτου.